Gra jest rozwinięciem i rozszerzeniem pomysłów zawartych w pierwszej części. Założenia fabularne są zakręcone jak sama gra - wielki odkurzacz, zwany Negativitronem, atakuje świat LittleBigPlanet. Sackboy, przy pomocy Larry'ego DaVinci, uchodzi z życiem i dołącza do Sojuszu, którego zadaniem jest pokonaniem złoczyńców.