Trąd, dżuma, ospa – między innymi te właśnie epidemie siały spustoszenie w Europie w ubiegłym tysiącleciu. Szymon Wrzesiński szczegółowo opisuje ich pojawianie się na ziemiach polskich. Ukazuje okoliczności wybuchu poszczególnych zaraz i przesądy z nimi związane – na przykład wpływ ciał niebieskich, obecność innowierców w państwie czy karę bożą jako ich przyczyny. Autor sporo uwagi poświęca także skutkom epidemii.
Podczas lektury odkrywamy, jak wielki wpływ na funkcjonowanie poszczególnych organów państwa – sejmu, dworu królewskiego, sądów – miały szerzące się zarazy. Dowiadujemy się także, jak próbowano leczyć masowe choroby i dlaczego sposoby te nie były skuteczne.
W „Epidemiach…” autor podejmuje się także opisu – nieraz makabrycznych i prowadzących do samookaleczenia – praktyk religijnych, którymi próbowano przebłagać Boga, by cofnął zsyłane pomory.