Gotham City nie ma chwili spokoju – kiedy tylko jedno niebezpieczeństwo zostaje zażegnane, od razu pojawia się kolejne. Tym razem po ulicach miasta szaleje Clayface, złoczyńca potrafiący zmieniać postać. Dokonuje on serii zuchwałych rabunków, po czym zabija swoich wspólników. Początkowo nawet Batman wydaje się bezradny wobec takiego przeciwnika, lecz udaje mu się złapać zmiennokształtnego bandytę. Jednak to dopiero początek rozgrywki z Clayface’em, który nie zamierza pozostać uwięziony w Arkham. Przy okazji poznajemy ciekawą historię dzieciństwa i młodości superłotra, dzięki czemu możemy zrozumieć motywy jego postępowania. Aby ostatecznie pokonać złoczyńcę, Mroczny Rycerz będzie musiał rozszyfrować jego powiązania z najdziwniejszymi postaciami ciemnej strefy Gotham.